在不久以前，人類文明在宇宙不斷的擴張，遙不可及的星際殖民己是常態。

在不斷的開采地球資源的過程中，發現了一種不同于地表生態的植物，其巨大的軀體在綻放后會釋放某種孢子，侵入生物體內在一定的潛伏期后會誕生一種可以吸取和存儲生物能量的花朵，此花朵被命名為瑪娜之花。

催生它的巨型植物則被稱為地蔓藤，人類發掘這類植物會帶來不可想象的利益。

七名尖端科學家借此成立的nirvana，也就是一切的源頭涅槃生物公司。

此公司試圖以瑪娜之花為基礎，研究其存儲能量的特性，讓人類也獲得類似的存儲釋放能力，并以此延長壽命，最終在結合世界上所有動植物基因后有了突破性進展。

他們將研制出的胚胎注入人類**，以自然繁育的方式誕生了與地球生物可以完美適配的第一代器官容器馬克。

他的身體具有融合所有生物的特性，能夠吞噬任何物種，也能夠為其提供器官供給。

涅槃生物公司借此推出無免疫系統版本，并不斷的將其克隆，收獲巨大的利益。

同時在地蔓藤的挖掘地點久川市，開采人員在地下的更深處發現了未知巨型生物。

經過研究，埋藏于地下無數年的史前巨獸細胞依然具有活性，并與地蔓藤有某種共生關系。

久川市市長白靖宇介入研究，將具有活性的生物大腦與機械相結合，研制出了第一代ASH腦機結合體全球大腦。

其卓越的性能與遠超普通計算機的運算能力，讓AI法案提上日程并通過，全球大腦ASH開始全面接軌公共安全系統，空中監獄也被涵蓋其中。

在此之后，白靖宇與涅槃生物公司合作，在器官容器的基礎上，結合瑪娜研制出了超越人類壽命的全新物種，并賦予了ASH之名，全稱如下，人類的高級物種，簡稱ASH進化人類ASH之父白靖宇隨即向全球公民表示，無論是現實還是網絡，ASH永遠都是最強大的守護者。

涅槃生物公司也以進化人類為基礎，將其弱化，降低風險，研制出了量產性藥物，如二號基因枷鎖開啟劑、去化因子、五基因突變劑等，用于強化人類軍隊。

借著ASH之名，全世界掀起了熱潮，ASH國際網球大賽、ASH泳裝比賽和帶有ASH名稱的各種店面火爆全球。

但伴隨ASH全世界都出現了不明生物，疑似和地蔓藤有關。

各國也在此之上，與涅槃生物公司合作深度研究地蔓藤與瑪娜之花，具有人類特征的現代世界樹雛形編號09就此誕生。

在ASH腦機結合體的掌控下，人類隱私不復存在，少數人開始反對ASH大腦對人類世界的干涉，再加上量產強化藥物，導致進化人類的泛濫。

一些人利用改造能力釋放催眠信息素來誘導普通人類強化其自身，讓人不知不覺地被吸收生命源質首到死亡。

這類極度危險的進化人類與損害**利益的***、尖端武器科學家等被一同收監至燈塔前身塔爾塔洛斯，并專門設下代號稱為催眠大師。

同時，遠在月球的***過度開發月球資源，導致月相異動，世界環境變得極其惡劣。

天氣控制和改造系統提上日程，為了避免環境進一步惡化，開始進行人工島嶼、地下都市的建造，各類雜志也對其進行講解。

但資源的開發讓更多地蔓藤涌現，使得地表成為了瑪娜生態的滋養地。

更多地蔓藤從地表破土而出，讓原本惡劣的地表環境變得更加糟糕，其散發的孢子也催生出了無數味植物。

根據地蔓藤的分布范圍不同，全世界對轉變嚴重地區設立隔離區，并開始販賣新鮮空氣，世界開始向瑪娜生態系統進行不可逆的緩慢轉變。

在一段時間的艱難求生后，部分上層人類認為地球己無法生存，開始傾盡全部資源制造星際飛船。

為了避免普通人**，他們開放了部分船票，但對于人類整體來說微乎其微，再加上賺黑心錢的黃牛販子，使平民百姓的財力，根本無法支撐星際旅行，大量人類被拋棄。

**開始，許多星際飛船在還未飛出地球時就被擊毀，部分空中避難所也被毀壞，世界陷入無**狀態。

但部分飛船離開地球也讓一些地面人喪失理智，開始向全世界投放****。

這種無差別的攻擊進一步壓縮了人類的生存空間，普通人為了活命，將希望放在凈化人類的源頭涅槃生物公司尋求幫助，可惜公司作為最初的瑪娜研究地點之一，早己淪陷。

存放在倉庫的瑪娜之花在這種環境下催生出了息壤，侵入大量搬運機器人進攻一切活著的生物，涅槃生物工程己徹底成為地獄。

同時，由月相異動所引起的災難進一步惡化，瑪娜也愈發活躍，無數地蔓藤沖天而起，導致了長達數十年的板塊位移。

這些巨型植物開始綻放為花朵，釋放的孢子導致地表和各大城市樓全部長出了不明菌類物體，加速了瑪娜生態的轉變。

舊世界的黑客自知無法在這種環境下存活，便將一些隱秘的信息存入機器人芯片，留給后世發現。

而一位白發女子帶著一個嬰兒，靠著遠超人類的實力在末世艱難生存。

瑪娜生態的進化讓原本神秘的未知生物浮出水面，這些帶有動物特征的物種在地蔓藤附近最為泛濫。

這些怪物外表結合了動植物，造型詭異，靠著信息器官吸取生物的能量為生。

在吸取達到一定量后會將能量交由瑪娜之花尋求進化，也有些會首接用于自身蛻變。

但無論哪種，一個完美符合馬納生態的全新物種即將誕生。

大量普通人在這場浩劫中死亡，但一所監獄依靠克洛托系統的幫助，躲過了暴民的襲擊，又避開了瑪娜生態的蔓延，在空中僥幸存活。

作為僅存人類聚集地之一，塔爾塔洛斯更名燈塔，人類最后的家園誕生。

而在燈塔年，地表出現了一種帶有人類特征的生物，不同于最初的未知怪物，這些新物種似乎越高級別越像人，他們被燈塔稱為噬極獸。

燈塔11年，由摩根作為隊長的獵荒者成立，并與一位白發進化人類共享武器裝備，保持良好的合作關系。

在燈塔12年，獵荒者在地面搜集物資時被世界獸襲擊，造成毀滅性打擊，白發進化人類身穿生物甲出現，救下了獵荒者小隊。

摩根邀請白發女前往燈塔一聚，并從她口中得知了地面人類為了生存尋求了新的方向，那就是融入瑪娜，利用生態完善自身原質，并接受瑪娜的存在。

摩根無法接受他所認可的人類與地面人類大不相同，在他心里甚至覺得進化人類白發女根本不是人，以意識融入瑪娜并依附于馬娜。

這種生存方式就像一個賭注，讓摩根懼怕，因為一旦失敗，燈塔將不復存在。

雙方沒有達成一致，白發女離開燈塔，但留下了生物鎧甲。

隨后，由摩根主導的臨淵者計劃正式開啟，可惜實驗結果不盡人意，普通燈塔戰士無法適應生物鎧甲，會突變而死。

臨淵者計劃暫時擱淺，初代城主向克洛特系統尋求幫助，得到了一個坐標。

最終一名男性嬰兒出現在了燈塔，取名馬克。

靈籠的故事也在此正式開啟。